21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2456 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  91.11 
 
 		 180 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  90.56 
 
 		 180 aa  321  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  91.11 
 
 		 180 aa  320  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  54.14 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  59.83 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  35.36 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  32.95 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  32.18 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  40.86 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  37.21 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  37.84 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  40.22 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  30.07 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  31.48 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0133  hypothetical protein  27.08 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1781  hypothetical protein  26.73 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1926  fimbrial assembly family protein  25 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1436  hypothetical protein  28.81 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0317201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1465  Fimbrial assembly family protein  24.82 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>