42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2420 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2420  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3509  glyoxalase family protein  95.2 
 
 		 125 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  87.8 
 
 		 125 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.25 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3096  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.83 
 
 		 120 aa  171  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0517504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1751  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.2 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  61.95 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1523  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.47 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216178  normal  0.435654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1171  hypothetical protein  58.47 
 
 		 126 aa  150  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1362  hypothetical protein  61.06 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.9 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.03 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3863  hypothetical protein  57.52 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.525519  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.28 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.59 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.32 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.32 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3509  hypothetical protein  47.32 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3164  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3254  hypothetical protein  47.32 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00230166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3161  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3227  hypothetical protein  48.21 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000491424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1344  hypothetical protein  48.28 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1370  hypothetical protein  47.41 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1508  hypothetical protein  47.37 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.67 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  49.56 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  47.41 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.54 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5790  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.57 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1019  glyoxalase family protein  40 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.07 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.18 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.39 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3048  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.27 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1026  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.054762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0259  glyoxalase family protein  45.76 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2150  putative bleomycin resistance protein  30.16 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.717419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2267  hypothetical protein  80.77 
 
 		 50 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.15 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0648  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 125 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>