14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1744 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1220  phage protein, putative  41.76 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370127  hitchhiker  0.0000602761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4582  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000093288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4032  phage protein  37.63 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.188318  unclonable  0.0000000000000276525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  30.41 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  33.61 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1173  bacteriophage signal peptide protein  36.96 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  33.61 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  35.42 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  39.18 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  27.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  30.77 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  30.13 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  30.13 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>