17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2187 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 351 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  46.93 
 
 		 381 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  40.5 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  34.09 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  34.4 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  27.7 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  27.7 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  35.4 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  28.03 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  27.82 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  26.79 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  23.47 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  25.54 
 
 		 250 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  24.82 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  21.83 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0488  type IV pilus assembly PilZ  23.42 
 
 		 224 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>