28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1234 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  73.23 
 
 		 198 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  68.69 
 
 		 198 aa  260  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.71 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  33 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  29 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  31.12 
 
 		 233 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  31.03 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.61 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  41.49 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  33.9 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  26.11 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  27.98 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  29.55 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  27.88 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.65 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  30.59 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.11 
 
 		 598 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>