15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1270 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 268 aa  550  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  72.45 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  74.05 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  60.98 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  60.69 
 
 		 268 aa  325  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  57.2 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  55.26 
 
 		 269 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1679  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.58 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.917084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  27.59 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  27.24 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  23.53 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0343  hypothetical protein  26.1 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.017583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3122  hypothetical protein  25.24 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1367  hypothetical protein  25.88 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2481  hypothetical protein  22.66 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>