13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1004 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1847  hypothetical protein  63.62 
 
 		 482 aa  636    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  961    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1816  hypothetical protein  66.15 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1373  hypothetical protein  57.6 
 
 		 478 aa  558  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00411865  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3878  hypothetical protein  39.09 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0238  hypothetical protein  41.15 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0374621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3925  hypothetical protein  39.19 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2876  hypothetical protein  32.68 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2968  hypothetical protein  33.18 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0993  hypothetical protein  31.44 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4257  hypothetical protein  26.94 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal  0.151056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0835  hypothetical protein  26.51 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2399  hypothetical protein  25.81 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>