15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0498 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  48.49 
 
 		 692 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  51.76 
 
 		 686 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  50 
 
 		 687 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  48.68 
 
 		 673 aa  649    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1393    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  43.99 
 
 		 656 aa  522  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  41.79 
 
 		 667 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  25.15 
 
 		 675 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  26.55 
 
 		 663 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  25.16 
 
 		 705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  24.89 
 
 		 692 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  24.78 
 
 		 669 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  21.48 
 
 		 685 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  25.08 
 
 		 658 aa  94.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  23.5 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>