33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4889 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4889  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  193  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  70.51 
 
 		 447 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  61.54 
 
 		 453 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  62.82 
 
 		 456 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  58.9 
 
 		 444 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  60.56 
 
 		 446 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  61.54 
 
 		 456 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
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NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.13 
 
 		 450 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
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NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  66.23 
 
 		 452 aa  80.1  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2961  hypothetical protein  60.26 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.026338  normal  0.521297 
 
 
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NC_002947  PP_2556  chromate transporter  57.69 
 
 		 450 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
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NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  57.69 
 
 		 450 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  64.94 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  51.95 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  57.89 
 
 		 456 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  51.32 
 
 		 442 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  61.11 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.58 
 
 		 457 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  47.5 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  56.94 
 
 		 454 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  44.87 
 
 		 456 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  51.28 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  36 
 
 		 483 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  51.92 
 
 		 451 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755683 
 
 
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NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  36.9 
 
 		 469 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
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NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  42.22 
 
 		 471 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600118 
 
 
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NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.34 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  34.65 
 
 		 461 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  34.09 
 
 		 443 aa  42.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  39.13 
 
 		 443 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.18 
 
 		 467 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  34.57 
 
 		 466 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.1 
 
 		 465 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
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