17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1990 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1990  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0562007  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2260  hypothetical protein  37.84 
 
 
325 aa  208  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3781  hypothetical protein  41.33 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185212  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1971  putative cointegrate resolution protein T  33.59 
 
 
301 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1803  hypothetical protein  48.94 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000895551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3043  putative cointegrate resolution protein  41.38 
 
 
291 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.57 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  30.16 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  28.3 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  28.3 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  26.11 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3578  mucin-associated surface protein  38.64 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00254533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1887  hypothetical protein  31.43 
 
 
321 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5051  mucin-associated surface protein  41.3 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  32.05 
 
 
350 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5161  mucin-associated surface protein  41.3 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7008  hypothetical protein  25.25 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>