12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1799 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1799  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3875  hypothetical protein  55.5 
 
 
181 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0057  hypothetical protein  47.85 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2514  hypothetical protein  46.73 
 
 
212 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1768  hypothetical protein  57.43 
 
 
165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0165694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0857  hypothetical protein  53 
 
 
162 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2627  hypothetical protein  32.69 
 
 
139 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3159  hypothetical protein  80 
 
 
364 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  36.36 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02129  hypothetical protein  35.71 
 
 
104 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.6002  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  36.36 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  36.36 
 
 
130 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>