60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3317 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  71.04 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  69.82 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  66.77 
 
 		 325 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  67.68 
 
 		 326 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  68.6 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  67.68 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  50.15 
 
 		 342 aa  315  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  50 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.74 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  34.21 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.77 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.75 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  29.9 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  33.64 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  25.69 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.65 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  34.49 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  26.89 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  24.46 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  29.09 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  29.46 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  24.69 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  24.43 
 
 		 603 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.75 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  26.28 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.74 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.45 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.69 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  25.69 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  26.52 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  26.52 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  26.52 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  25 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.29 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  25.15 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  24.41 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  24.24 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.33 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.19 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.81 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  26.48 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  25.59 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.93 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  21.32 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.02 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.75 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.07 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.3 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  21.88 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.57 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  25.19 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.22 
 
 		 509 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  27.27 
 
 		 181 aa  46.2  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.18 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  26.85 
 
 		 160 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25 
 
 		 191 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  37.36 
 
 		 511 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  28.23 
 
 		 188 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>