43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0808 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  205  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  44.94 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  41.76 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  43.96 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  43.48 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  41.3 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  42.7 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  38.2 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  41.11 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  41.11 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  41.76 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  41.76 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4084  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000391482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  43.82 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  38.95 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  37.08 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  39.39 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  34.78 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  43.82 
 
 		 103 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  42.05 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  41.57 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  41.57 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  38.64 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  35.96 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2008  hypothetical protein  35.85 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  30.85 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  36.26 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  34.88 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5985  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  35.29 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  24.44 
 
 		 349 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127229 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3756  hypothetical protein  36.54 
 
 		 74 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0451  hypothetical protein  32.91 
 
 		 106 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>