15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0146 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0075  hypothetical protein  74.63 
 
 		 67 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0121  hypothetical protein  73.13 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932988  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0123  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0126  hypothetical protein  68.66 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.831576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01330  hypothetical protein  76.12 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861282  normal  0.982604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0184  hypothetical protein  73.13 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00980  hypothetical protein  74.24 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  48.28 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0066  hypothetical protein  63.41 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0040  DNA polymerase A  40.58 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  38.98 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>