16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3393 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2306  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000308727  hitchhiker  0.000144115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3393  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.931175  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1220  hypothetical protein  90 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4152  hypothetical protein  85.71 
 
 		 70 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00965176  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0554  hypothetical protein  72.86 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0989  hypothetical protein  63.49 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2231  hypothetical protein  63.93 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2348  hypothetical protein  61.9 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2824  hypothetical protein  60.32 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5403  hypothetical protein  55.38 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0655  hypothetical protein  60 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4998  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463323  normal  0.081215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59430  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00170596  hitchhiker  3.38661e-16 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0265  hypothetical protein  49.21 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2693  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.569654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2461  hypothetical protein  51.06 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041259  hitchhiker  0.00000000509253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>