16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1220 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1220  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  255  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2306  hypothetical protein  74.55 
 
 
137 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000308727  hitchhiker  0.000144115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4152  hypothetical protein  94.29 
 
 
70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00965176  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3393  hypothetical protein  90 
 
 
70 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.931175  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0554  hypothetical protein  75.71 
 
 
70 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2231  hypothetical protein  63.01 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123802  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0989  hypothetical protein  61.33 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2348  hypothetical protein  65.08 
 
 
78 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2824  hypothetical protein  65.08 
 
 
77 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5403  hypothetical protein  56.92 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0655  hypothetical protein  56.58 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4998  hypothetical protein  56.92 
 
 
68 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463323  normal  0.081215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59430  hypothetical protein  46.75 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00170596  hitchhiker  3.38661e-16 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0265  hypothetical protein  55.93 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2693  hypothetical protein  46.38 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.569654  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2461  hypothetical protein  54.35 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041259  hitchhiker  0.00000000509253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>