15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2693 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2693  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.569654  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0265  hypothetical protein  52.11 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2824  hypothetical protein  55 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4998  hypothetical protein  52.46 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463323  normal  0.081215 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5403  hypothetical protein  49.21 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2231  hypothetical protein  55.77 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123802  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0989  hypothetical protein  55.77 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2348  hypothetical protein  55.77 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0554  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0655  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1220  hypothetical protein  46.38 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4152  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00965176  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2306  hypothetical protein  42.03 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000308727  hitchhiker  0.000144115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3393  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.931175  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59430  hypothetical protein  46.94 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00170596  hitchhiker  3.38661e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>