16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0655 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0655  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2824  hypothetical protein  71.43 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0989  hypothetical protein  59.74 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0554  hypothetical protein  64.06 
 
 
70 aa  83.6  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2348  hypothetical protein  58.44 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2231  hypothetical protein  59.46 
 
 
78 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1220  hypothetical protein  56.58 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2306  hypothetical protein  54.67 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000308727  hitchhiker  0.000144115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3393  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.931175  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4152  hypothetical protein  61.54 
 
 
70 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00965176  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5403  hypothetical protein  53.73 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0265  hypothetical protein  52.7 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111063 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4998  hypothetical protein  50.77 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463323  normal  0.081215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2693  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.569654  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59430  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00170596  hitchhiker  3.38661e-16 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2461  hypothetical protein  56.52 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041259  hitchhiker  0.00000000509253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>