29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2628 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1728  hypothetical protein  58.46 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1927  hypothetical protein  52.94 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1261  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2541  hypothetical protein  57.81 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459141  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1223  hypothetical protein  56.25 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1114  hypothetical protein  57.35 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0831  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0522629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2810  hypothetical protein  54.29 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1766  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3207  hypothetical protein  53.62 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1983  hypothetical protein  51.47 
 
 		 68 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1569  hypothetical protein  51.47 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0870205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2578  hypothetical protein  54.41 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3287  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.558617  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2136  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.621676  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5230  hypothetical protein  52.86 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179685  normal  0.0954589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3915  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3143  hypothetical protein  52.94 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3736  hypothetical protein  50.72 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2175  hypothetical protein  51.47 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2110  hypothetical protein  54.29 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.773759  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2062  hypothetical protein  54.29 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2386  hypothetical protein  54.29 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1068  hypothetical protein  45.71 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3775  hypothetical protein  51.43 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0927  hypothetical protein  48.39 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23234  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2004  hypothetical protein  39.71 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0075  hypothetical protein  45.9 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.176037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>