22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2004 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2004  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1983  hypothetical protein  54.41 
 
 
68 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1927  hypothetical protein  38.24 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1261  hypothetical protein  35.29 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1223  hypothetical protein  35.29 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2628  hypothetical protein  39.71 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253384 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0831  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0522629  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3736  hypothetical protein  39.71 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3207  hypothetical protein  33.82 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2136  hypothetical protein  32.35 
 
 
72 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.621676  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3287  hypothetical protein  32.35 
 
 
72 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.558617  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2578  hypothetical protein  33.82 
 
 
72 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1728  hypothetical protein  36.76 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3915  hypothetical protein  32.35 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5230  hypothetical protein  32.35 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179685  normal  0.0954589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2175  hypothetical protein  32.35 
 
 
72 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364146  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3143  hypothetical protein  32.35 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416717  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2541  hypothetical protein  33.82 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1114  hypothetical protein  35.29 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1766  hypothetical protein  32.35 
 
 
67 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1569  hypothetical protein  33.82 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0870205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1068  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>