24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1068 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1068  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101352  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2628  hypothetical protein  45.71 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1114  hypothetical protein  49.21 
 
 
67 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2541  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1766  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1569  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0870205 
 
 
-
 
NC_004310  BR1261  hypothetical protein  42.19 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1223  hypothetical protein  42.19 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1927  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2110  hypothetical protein  41.18 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.773759  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2386  hypothetical protein  41.18 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2062  hypothetical protein  41.18 
 
 
71 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1728  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3775  hypothetical protein  39.13 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2810  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3207  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0831  hypothetical protein  37.14 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0522629  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2136  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.621676  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3287  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.558617  normal  0.0261895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2004  hypothetical protein  39.13 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2578  hypothetical protein  33.8 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3915  hypothetical protein  32.39 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2175  hypothetical protein  32.39 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364146  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5230  hypothetical protein  32.35 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179685  normal  0.0954589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>