53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2307 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 598 aa  1201    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 		 601 aa  465  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  41.6 
 
 		 560 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  44.58 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  43.31 
 
 		 623 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  44.13 
 
 		 587 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.26 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  43.4 
 
 		 625 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  42.38 
 
 		 581 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  45.21 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  42.69 
 
 		 625 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  42.25 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.59 
 
 		 572 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.7 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  40.2 
 
 		 580 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  36.94 
 
 		 578 aa  351  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  40.81 
 
 		 568 aa  346  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  40.86 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  37.8 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 		 552 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  39.84 
 
 		 533 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  34.15 
 
 		 577 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  33.01 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  33.66 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 563 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 565 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 563 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 584 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 559 aa  223  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 574 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 559 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  33.27 
 
 		 601 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  28.69 
 
 		 576 aa  213  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 		 559 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 		 600 aa  200  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  26.96 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  27.29 
 
 		 530 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 530 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 541 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  28.63 
 
 		 556 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 		 871 aa  107  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 506 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  33.66 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 537 aa  49.3  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  38.82 
 
 		 734 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>