24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1263 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1263    100 
 
 
288 bp  571  1e-161  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1262  transposase, IS605 OrfB  88.57 
 
 
816 bp  113  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  86.72 
 
 
1206 bp  103  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  86.67 
 
 
1224 bp  95.6  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1033  transposase, IS605 OrfB  88.89 
 
 
1323 bp  89.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000086107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0112  paREP12  87.5 
 
 
249 bp  87.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210379  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1003    86.75 
 
 
374 bp  77.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.539082  hitchhiker  0.000396797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1731  transposase, IS605 OrfB  86.67 
 
 
981 bp  69.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0586  transposase IS605 OrfB  92 
 
 
1242 bp  67.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.732197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  85.42 
 
 
885 bp  63.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  85.42 
 
 
1332 bp  63.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1179  transposase, IS605 OrfB  91.3 
 
 
1251 bp  60  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1771    91.11 
 
 
213 bp  58  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1720  transposase, IS605 OrfB  91.11 
 
 
1266 bp  58  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.720564  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0158  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
237 bp  54  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1380    84 
 
 
156 bp  54  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.638331  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0369  paREP12  100 
 
 
561 bp  54  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.532403 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1530  IS605 family transposase OrfB  87.04 
 
 
1242 bp  52  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0242937  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  94.12 
 
 
1260 bp  52  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1333  IS605 family transposase OrfB  86.79 
 
 
1434 bp  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0644  transposase, IS605 OrfB  86.79 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0667565  hitchhiker  0.00187927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  93.75 
 
 
1458 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0122    82.89 
 
 
4039 bp  48.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.44906  normal  0.010671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  82.89 
 
 
1254 bp  48.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>