32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2315 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  540  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  68.22 
 
 
259 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  58.98 
 
 
265 aa  314  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  35.12 
 
 
293 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  34.47 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  34.62 
 
 
280 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  33.46 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  33.71 
 
 
289 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  31.82 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  30.15 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  28.3 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  29.75 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  26.32 
 
 
282 aa  89  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  28.86 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3873  2OG-Fe(II) oxygenase  26.32 
 
 
289 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0524705  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0625  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  25.44 
 
 
270 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0111909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4468  2OG-Fe(II) oxygenase  25.62 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4297  2OG-Fe(II) oxygenase  25.44 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.368434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1804  2OG-Fe(II) oxygenase  26.32 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  29 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  26.22 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  26.22 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3395  2OG-Fe(II) oxygenase  26.22 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1911  2OG-Fe(II) oxygenase  26.83 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3538  2OG-Fe(II) oxygenase  26.22 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4019  2OG-Fe(II) oxygenase  24.38 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  0.70334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  29 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4656  hypothetical protein  29 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0783  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.72 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0694  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.72 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2069  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.72 
 
 
283 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1905  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  23.72 
 
 
257 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>