23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3853 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  340  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  61.82 
 
 
165 aa  223  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7171  DinB family protein  59.88 
 
 
170 aa  205  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0081  DinB  44.16 
 
 
164 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  38.89 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  34.34 
 
 
172 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  34.67 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  32.72 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4545  DinB  33.13 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.104149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2209  DinB family protein  27.22 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  24 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0178  DinB family protein  28.03 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  22.7 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  22.7 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  22.7 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  22.7 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1058  DinB family protein  27.67 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  23.78 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  22.7 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  23.46 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  21.47 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  22.56 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  21.47 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>