16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2537 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1387    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  34.15 
 
 
705 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  33.84 
 
 
669 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  34.07 
 
 
692 aa  343  5e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  30.23 
 
 
685 aa  290  6e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  27.82 
 
 
663 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  25.47 
 
 
658 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  24.5 
 
 
686 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  26.54 
 
 
687 aa  165  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  25.15 
 
 
678 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  25.4 
 
 
667 aa  159  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  24.02 
 
 
673 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  23.85 
 
 
668 aa  150  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  25.63 
 
 
656 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  24.3 
 
 
692 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  23.88 
 
 
262 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>