63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5044 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 232 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  53.48 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  53.48 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  52.42 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  49.78 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  49.34 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  46.05 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  46.46 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  42.6 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  39.46 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  40.36 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  39.46 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  39.46 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  39.46 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  39.46 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  40.36 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  40.97 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  39.91 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  39.46 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  42.6 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  41.26 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  39.01 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  40.36 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  38.12 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  37.22 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  39.21 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  37.67 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  41.26 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  37.17 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  37.39 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  35.24 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  35.24 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  35.24 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  35.24 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  35.24 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  35.24 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  34.8 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  34.8 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  34.65 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  34.21 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  34.21 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  34.21 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  34.76 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  33.94 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  34.22 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  32.16 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4580  phage shock protein A, PspA  35.59 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606937  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  32.95 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  33.52 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4514  phage shock protein A, PspA  34.96 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0564095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  28.44 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1604  phage shock protein A, PspA  31.02 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768774 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  26.34 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1582  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5874  phage shock protein A, PspA  26.96 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0680  phage shock protein A, PspA  34.78 
 
 		 379 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.0117728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0668  PspA/IM30 family protein  34.78 
 
 		 379 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.655939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  26.64 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1270  phage shock protein A, PspA  26.2 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  22.69 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>