10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4461 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4461  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  193  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1399  hypothetical protein  51.52 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4324  hypothetical protein  51.52 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.999559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4413  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1040  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.527359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0565  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398065  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4297  hypothetical protein  45.28 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5706  hypothetical protein  37.29 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.989456  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3250  hypothetical protein  36.21 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2088  hypothetical protein  33.9 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>