13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4230 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4230  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318595  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4074  hypothetical protein  62.04 
 
 		 137 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1643  hypothetical protein  61.31 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2991  membrane protein-like protein  60.29 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52000  hypothetical protein  55.07 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4561  hypothetical protein  54.35 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.672359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1205  hypothetical protein  60.58 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1245  hypothetical protein  58.78 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000160953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36840  hypothetical protein  62.96 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.693285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1898  hypothetical protein  36.51 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  29.57 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  27.68 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  23.01 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>