20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3714 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  217  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2417  hypothetical protein  59.3 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230843  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2684  hypothetical protein  59.3 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4471  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3981  hypothetical protein  37.78 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2298  hypothetical protein  38.95 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2394  hypothetical protein  39.36 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.957561  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2434  hypothetical protein  39.36 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5715  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1777  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2389  hypothetical protein  38.3 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0901  hypothetical protein  38.3 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1814  hypothetical protein  60.42 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  37.76 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5730  putative signal peptide protein  42.7 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3349  hypothetical protein  54.93 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7068  hypothetical protein  38.2 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  46 
 
 		 2764 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2446  signal peptide protein  48.44 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>