28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_R0051 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_R0051  tRNA-Sec  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0506501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0005  tRNA-Sec  90.22 
 
 		 92 bp  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3332  selenocysteine-specific translation elongation factor  89.77 
 
 		 2076 bp  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.665581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0001  tRNA-Sec  100 
 
 		 91 bp  81.8  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63460  tRNA-Sec  85.92 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5525  tRNA-Sec  85.92 
 
 		 96 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4154  tRNA-Sec  92.68 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577336  normal  0.0295304 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0001  tRNA-Sec  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4296  tRNA-Sec  92.68 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0021  tRNA-Sec  88.24 
 
 		 95 bp  56  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.926478 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0001  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4706  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5080  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00063  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.964217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5031  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0001  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4001  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4138  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3968  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.406998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4159  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4031  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4077  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.981278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3958  tRNA-Sec  90.24 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0002  tRNA-Sec  83.82 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0079  tRNA-Sec  83.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0052  tRNA-Sec  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0078  tRNA-Sec  83.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0005  tRNA-Sec  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>