38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3650 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  205  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  55.68 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  56.82 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  56.82 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  58.14 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  55.06 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  51.11 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  55.29 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  57.65 
 
 		 100 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  55.29 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  46.67 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  47.67 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  52.94 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  46.46 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  44.12 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  43.68 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  43.68 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  44.44 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  44.57 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  43.48 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  44.21 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  40.22 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  40.45 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  39.56 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  38.95 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  41.3 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  38.54 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  40.96 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0451  hypothetical protein  47.92 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  33.75 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  29.67 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4084  hypothetical protein  32.63 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000391482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0104  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  40.8  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>