13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3173 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0526  hypothetical protein  46.91 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3181  hypothetical protein  50.62 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0188675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3837  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0738372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7727  hypothetical protein  50.77 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0599246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3073  hypothetical protein  42.11 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1515  hypothetical protein  44.93 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3018  hypothetical protein  46.27 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3814  hypothetical protein  39.68 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2340  hypothetical protein  38.98 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3912  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0128  hypothetical protein  32.95 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281023  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3344  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.900156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>