204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0824 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  60.57 
 
 		 316 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  60.88 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  60.57 
 
 		 316 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  43.63 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  42.54 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  43.17 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  41.51 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  42.77 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  44.03 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  43.44 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  40.75 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  41.27 
 
 		 313 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  44.65 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  44.34 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  44.34 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  43.53 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  42.77 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  43.04 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  42.37 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  43.35 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  42.36 
 
 		 313 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  42.41 
 
 		 314 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  43.85 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  43.85 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  43.85 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  40.13 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  42.22 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  41.59 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  44.16 
 
 		 314 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  44.16 
 
 		 314 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  42.52 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  42.05 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  42.52 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  41.56 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  41.56 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  42.05 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  42.05 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  41.56 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  41.56 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  42.41 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  41.72 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  41.56 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  41.56 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  41.43 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  38.41 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  35.45 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  38.41 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  37.23 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  37.78 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  36.92 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  37.74 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  36.25 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  39.31 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  35.53 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  36.51 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  38.99 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  38.68 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  36.71 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  35.51 
 
 		 318 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  34.78 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  34.78 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  36.14 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  36 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  36 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  36.86 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  36.45 
 
 		 319 aa  185  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  35.38 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  34.48 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  34.05 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  35.05 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  36.36 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0520  hypothetical protein  37.62 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582097  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  34.57 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  37.06 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  34.67 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  34.98 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  35.49 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  35.6 
 
 		 316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  35.29 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  32.6 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  35.22 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  35.19 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  32.61 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  34.04 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  35.56 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  34.06 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  34.25 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  35.2 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  33.94 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  34.46 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3575  hypothetical protein  34.06 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  33.23 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  32.11 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0539  hypothetical protein  32.08 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  31.8 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0646  protein of unknown function DUF403  30.98 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>