40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0943 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0943  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000208116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0037  protein of unknown function UPF0227  35 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4964  hypothetical protein  24.18 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0498  hypothetical protein  24.53 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2009  esterase YqiA  28.85 
 
 
195 aa  48.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43490  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0550  hypothetical protein  24.18 
 
 
205 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2671  esterase YqiA  31.78 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2624  hypothetical protein  28.71 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1607  hypothetical protein  25.33 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3328  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.33198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  22.64 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  22.64 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3555  hypothetical protein  26.12 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal  0.0880721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4792  hypothetical protein  27.37 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528676  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2284  hydrolase, putative  27.05 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4916  hypothetical protein  27.37 
 
 
247 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4708  hypothetical protein  29.47 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.731095 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0577  esterase YqiA  26.67 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3559  hypothetical protein  26.45 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0280  esterase YqiA  26.67 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  27.37 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0658  esterase YqiA  26.67 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0989  hypothetical protein  27.12 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.271686  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3421  protein of unknown function UPF0227  27.72 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0845  hypothetical protein  27.12 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.294415  normal  0.359517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4177  hypothetical protein  51.28 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  25.51 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2487  hypothetical protein  23.33 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0729  hypothetical protein  31.76 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0318  esterase YqiA  26.47 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2256  hypothetical protein  28.28 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2793  hypothetical protein  22 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0537  esterase  27.72 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1638  hypothetical protein  23.46 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3900  hypothetical protein  23.31 
 
 
191 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0434  hypothetical protein  23.04 
 
 
197 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1327  hypothetical protein  26.25 
 
 
180 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54974  hydrolase  30.4 
 
 
494 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4191  hypothetical protein  28 
 
 
192 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>