20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0527 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  90.41 
 
 
74 aa  141  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  91.78 
 
 
73 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  83.56 
 
 
73 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  90.91 
 
 
55 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  65.75 
 
 
77 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  47.69 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  37.68 
 
 
74 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  49.15 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  52.54 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  40.98 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  48.21 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  42 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  30.91 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  38 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  29.09 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3246  hypothetical protein  35 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2486  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  32.86 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>