16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0159 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0159  nucleotide kinase  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0729  nucleotide kinase-like protein  36.57 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0034  nucleotide kinase-like protein  37.5 
 
 
229 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2012  ATPase  35.37 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.378806  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  30.25 
 
 
444 aa  88.2  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1583  protein of unknown function DUF265  26.19 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2900  protein of unknown function DUF265  27.01 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0296  protein of unknown function DUF265  25.81 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1717  putative NTPase  31.25 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0465862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1537  putative NTPase  31.91 
 
 
175 aa  47  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3054  putative NTPase  26.09 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507347  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1005  putative NTPase  29.63 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0312  hypothetical protein  25.44 
 
 
173 aa  45.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0721  hypothetical protein  28.19 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.763647  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0909  putative NTPase  28.35 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0548  putative NTPase  28.57 
 
 
174 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.955117  normal  0.0174425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>