19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2043 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2043  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  670    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0138958 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0975  egghead-like protein  74.05 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0056  egghead-like protein  71.14 
 
 		 341 aa  464  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.350451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1076  hypothetical protein  66.76 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0793139 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 		 509 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 549 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 420 aa  49.3  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.97 
 
 		 694 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 428 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.77 
 
 		 845 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  29.87 
 
 		 788 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 789 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 789 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.46 
 
 		 789 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 686 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.22 
 
 		 811 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 654 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 411 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>