28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1362 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1362  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
405 aa  783    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.275074 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1340  glycosyl transferase, group 1  52.37 
 
 
407 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.541774  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0274  glycosyl transferase group 1  52.45 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0597  glycosyl transferase, group 1  49.26 
 
 
404 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.287593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.36 
 
 
425 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
353 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
425 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.6 
 
 
935 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  35.29 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
346 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
390 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  19.02 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
390 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>