13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1116 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  999    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2024  hypothetical protein  30.48 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534725  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4898  hypothetical protein  28.21 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1144  hypothetical protein  24.12 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.548609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0239  hypothetical protein  32.19 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.780841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  28.85 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5148  hypothetical protein  35.14 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1940  hypothetical protein  32.2 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0682  hypothetical protein  21.31 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1894  hypothetical protein  28.57 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.557849  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1329  hypothetical protein  22.86 
 
 		 456 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.295723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>