56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0942 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0942  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  374  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0424238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3668  hypothetical protein  60.56 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000166039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00035  hypothetical protein  49.43 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  31.43 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01920  lipidA 3-O-deacylase  29.73 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0006  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  33.33 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0024  hypothetical protein  28.15 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0993  hypothetical protein  27.68 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262375  normal  0.178793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0849  hypothetical protein  27.68 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  31.09 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  31.93 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1064  hypothetical protein  33.61 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  31.93 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1324  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.232671  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61650  Lipid A 3-O-deacylase  32.5 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0713933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0953  hypothetical protein  31.71 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  31.93 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0022  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5636  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3020  hypothetical protein  26.88 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5424  hypothetical protein  30.66 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3154  hypothetical protein  30.53 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0288324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4028  signal peptide protein  29.83 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0571  hypothetical protein  27.74 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.00795396 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  24.48 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2892  hypothetical protein  31.3 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0302  hypothetical protein  29.09 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2700  hypothetical protein  31.3 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4145  hypothetical protein  30.28 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2560  hypothetical protein  29.84 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0010  hypothetical protein  27.64 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0346  hypothetical protein  25.74 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22064  hitchhiker  0.000122714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0023  hypothetical protein  26.39 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1159  hypothetical protein  23.14 
 
 		 220 aa  50.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  22.34 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0457  hypothetical protein  24.71 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03145  signal peptide protein  27.42 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.561242 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1482  hypothetical protein  22.56 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2911  hypothetical protein  22.56 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0565  hypothetical protein  22.56 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0549  hypothetical protein  22.56 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0106  hypothetical protein  22.56 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0487  hypothetical protein  26.15 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0203  putative signal peptide protein  25 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3136  hypothetical protein  22.56 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0732  hypothetical protein  22.56 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0504  hypothetical protein  30.25 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  23.08 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  23.08 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4292  signal peptide protein  25 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4180  putative signal peptide protein  25 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0328239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  20.86 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  20.86 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  20.86 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>