16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2054 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2054  ribosome biogenesis protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.532085 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1803  ribosome biogenesis protein  69.68 
 
 		 221 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.022092  normal  0.296556 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0820  ribosome biogenesis protein  71.49 
 
 		 221 aa  310  1e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1590  ribosome biogenesis protein  68.32 
 
 		 221 aa  277  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0045  Suppressor Mra1 family protein  39.91 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0557  ribosome biogenesis protein  44.34 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0915  Suppressor Mra1 family protein  45.36 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13379  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0747  ribosome biogenesis protein  42.33 
 
 		 209 aa  155  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0675798  normal  0.0968898 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0188  ribosome biogenesis protein  42.4 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0625  ribosome biogenesis protein  35.43 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1625  ribosome biogenesis protein  32.26 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02759  RNA processing protein Emg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06010)  26.9 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.458215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01990  nucleolar essential protein 1, putative  44.07 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55133  predicted protein  28.34 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0189665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11653  predicted protein  39.68 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432988  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39810  predicted protein  28.09 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.368845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>