9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1439 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1439  30S ribosomal protein S27ae  100 
 
 		 65 aa  137  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143356  normal  0.0246372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1894  30S ribosomal protein S27ae  86.57 
 
 		 67 aa  123  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0307  30S ribosomal protein S27ae  83.08 
 
 		 65 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  83.08 
 
 		 63 aa  117  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  77.55 
 
 		 72 aa  93.6  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  54.9 
 
 		 53 aa  71.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  48.33 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  51.02 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  40 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>