28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06133 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06133  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01033  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00365727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  56.59 
 
 		 349 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.66 
 
 		 355 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  41.59 
 
 		 354 aa  73.6  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 357 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  36.21 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  36.21 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  34.48 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 348 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.93 
 
 		 347 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 		 346 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 		 352 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  34.21 
 
 		 358 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 346 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.13 
 
 		 341 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.13 
 
 		 341 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  32.74 
 
 		 332 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  42.59 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1952  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 341 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.755227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>