15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04711 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04711  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2168  hypothetical protein  33.04 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  26.4 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  26.16 
 
 
464 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  28.93 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  28.93 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  28.43 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0411  hypothetical protein  25.71 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  25.84 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  24.65 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  23.86 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  25.24 
 
 
346 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  25.24 
 
 
346 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2556  hypothetical protein  25.5 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.677539  normal  0.127216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  31.97 
 
 
335 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>