15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03361 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03361  VirK  100 
 
 		 143 aa  296  6e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1194  VirK family protein  56.43 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2875  VirK family protein  57.26 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1391  VirK family protein  50.68 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2998  hypothetical protein  43.9 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2879  VirK  41.35 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1027  VirK protein  42.02 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.242513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0903  VirK family protein  42.02 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.927104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2285  putative signal peptide protein  41.41 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0891  hypothetical protein  32.62 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0980  hypothetical protein  38.39 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1256  hypothetical protein  35.64 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2196  hypothetical protein  27.27 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00124751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1796  hypothetical protein  23.53 
 
 		 138 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1795  hypothetical protein  22.79 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>