15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01402 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  100 
 
 		 264 aa  544  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1094  GumL  45.95 
 
 		 274 aa  248  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  43.94 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  40.77 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  33.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  28.52 
 
 		 390 aa  89  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  33.82 
 
 		 625 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  31.74 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4937  hypothetical protein  31.43 
 
 		 696 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.84 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  27.93 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  26.49 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4949  ExoV-like protein  27.93 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.831937  normal  0.31532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  27.43 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  26.52 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>