26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0074 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0074  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.908723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  68.18 
 
 		 68 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0851  hypothetical protein  59.38 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5816  hypothetical protein  73.02 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595083  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  50.77 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0631  hypothetical protein  42.19 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  48.39 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  39.39 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5803  hypothetical protein  72.73 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550246  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5124  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  36.92 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  39.34 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  38.1 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  40.32 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  36.51 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  35.48 
 
 		 70 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  36.07 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>