12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0066 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0066  traU protein  100 
 
 		 1018 aa  2106    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.865  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0060  traU protein  98.72 
 
 		 1015 aa  2080    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0088  TraU  49.36 
 
 		 1014 aa  1043    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.83032 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0498  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1009 aa  356  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0522  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1009 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0376  IcmB  27.33 
 
 		 1003 aa  336  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1806  IcmB protein  27.33 
 
 		 1003 aa  336  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3870  DotO  27.17 
 
 		 1018 aa  307  8.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.103513  normal  0.825966 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0121  putative type IV secretion system protein IcmB/DotO  25.26 
 
 		 1031 aa  294  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4253  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1019 aa  225  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5592  hypothetical protein  24.35 
 
 		 995 aa  208  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0517129  normal  0.0408672 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  27.1 
 
 		 866 aa  44.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>