61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4318 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  100 
 
 		 326 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  85.58 
 
 		 326 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  69.63 
 
 		 325 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  71.17 
 
 		 325 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  69.33 
 
 		 326 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  69.33 
 
 		 326 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  68.6 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  49.85 
 
 		 342 aa  322  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  48.17 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  37.88 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  32.88 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.81 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  28.83 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  30.82 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.89 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  30.22 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  26.52 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  23.84 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  31.02 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.31 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  24.77 
 
 		 603 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  28.22 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.24 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.44 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  24.38 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.41 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.21 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  22.53 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  26.97 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  26.97 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  26.97 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  27.24 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  24.68 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  25.74 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  29.39 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  24.15 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.57 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.18 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.14 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.23 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.45 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  25.85 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  23.39 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.92 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.47 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  25.6 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.57 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.85 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.27 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  26.01 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.92 
 
 		 191 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.62 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.26 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  25.66 
 
 		 160 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.26 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  32.77 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  37.08 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0524  hypothetical protein  27.12 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.2 
 
 		 379 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>